左梦庚在宋文海的追击下，仓惶逃回九江，清点兵马，发现许多军头带着自己的手下不告而别，令左梦庚即愤怒又无可奈何，这些人本来就是一群墙头草，左良玉还在时，明面上还能压制。
如今左良玉不在了，左梦庚又与朝廷的水师交战失利，并且朝廷的大军很快就会到来围剿，这些人可不会为左梦庚陪葬，便趁乱各自带着麾下的人马脚底抹油开溜。离开目前在朝廷挂上号的左梦庚。而左梦庚回到九江后，由于没有了左良玉的约束，便开始放纵自己，天天花天酒地，日子倒也过得遐逸。
一个月后，秦琼、李岩率大军二十万与李靖的三十万大军合围左梦庚于九江，左梦庚在李国英，卢光祖，金声恒，徐勇等人的劝说下率领二十三位总兵官出城投降。
宋师道得到消息后，命令秦琼、李岩带着左梦庚以及李国英，卢光祖，金声恒，徐勇等二十三个总兵官返回燕京，左梦庚麾下的大军由李靖进行整编。
李靖踢出老弱，挑选出五万人马，加入朝廷的军队，其余数十万人其实其中都是沿途裹挟的民众，投降的农民军，还有各种家属，工匠等等。真正能打仗的部队，其实很少。所以几十万人，李靖才挑选出五万。
工匠分门别类进入各个工坊，农民发放粮食、土地，重新变成农民务农，李靖忙活了近一个月才处理好这些杂事。随后水路并进，兵发福建。
郑芝龙此时的船队里包括汉人、倭人、朝鲜人、南岛语族、非洲黑人等各色人种，能战之士高达二十万，拥有超过三千艘大大小小的船只，成为华东与华南海洋世界的霸主。
但是当郑芝龙得知朝廷三桅战船、五桅战船、七桅战船上面装备的新式火炮犀利异常，威力惊人，比自己战船上装备的火炮射程更远，威力更大，且兵力达到恐怖的三十五万，是自己的近一倍，自己的人马很可能不是对手，并且郑芝龙本人已年到中年，他也失去了雄心壮志，便率部投降。
宋师道得知消息后大喜，加封郑芝龙为南安侯，并请郑芝龙到京城为官，让郑芝龙的船队与宋文海的舰队合并，并任命郑成功为舰队的副帅。至此整个江南平定，人民开始安居乐业。
随着江南，江北的平定，整个大明也步入正常的轨道，傅天仇等人上书，国不可一日无君，奏请早日确立新君，以安民心。宋师道与众人经过多次磋商，妥协。最终决定立长平公主朱媺娖为帝，宋师道为摄政王，总领全国的军政要务。
傅天仇为丞相掌管政务，李靖为军机大臣掌管军务，秦琼为全国兵马大元帅，裴行俨为上将执掌十万禁卫军，赵云为上将执掌北部边境的四十万大军，宋文海为上将执掌大明海军。
经过一年多的全力发展和恢复，以及海上贸易的蓬勃发展，运回了大量的粮食，金银。千疮百孔的大明朝恢复了一点元气，百姓也脱离了食不果腹的窘地。大明皇帝朱媺娖也顺利的诞下一子宋志明，百天后就被立为太子。
冬去春来，随着新明朝境内的平定，彻底解决北地边患也被提上了日程，四月初六，摄政王宋师道亲自率领大军三十万，从山海关出发向满清的老巢盛京发起了进攻。而宋文海和郑成功则率领十万海军从北海登陆，两路大军水路并进直逼盛京。
兵马大元帅秦琼秦叔宝统领八万骑兵，十七万步兵共计二十五万大军。随行将领有上将赵云赵子龙、中将史可法、中将黄公辅、中将阎应元、少将李来亨、少将堵胤锡、少将李定国（原张献忠部下）、少将张煌言、以及大校李国英、大校卢光祖、大校金生恒、大校徐勇、大校水鉴等等数十员大校。
上将裴行俨则统领骑兵两万，步兵三万共计五万禁卫军护卫在宋师道的身旁。三十万大军浩浩荡荡出山海关、经宁远、锦州、渡过大凌河，攻下西平堡大军继续北上。
宋文海、郑成功率领海军从北海进入三岔河，沿河北上，驶向盛京。
三十万大军，一路上势如破竹，清兵把守的关、堡，在九寸火炮的攻击下一一攻克，沿途被满清掳到北地的汉人揭竿而起，杀死满人奴隶主，迎接朝廷的大军，当他们看到朝廷的大军时，一个个欢欣鼓舞、痛哭失声，
宋师道派老将黄公辅统帅两万人马安抚这些北地汉人，分了满人奴隶主的财物，牛羊给他们，让他们安心在此生活，并告诉他们，这里以后就是大明的疆土了。他们以后也不再是任何人的奴隶，朝廷会在此地驻军，建城。保护他们的生命财产。
北地汉人一个个喜极而泣，并有许多人要求加入军队，讨伐满清。宋师道考虑到他们熟悉地形，就择优录取了一部分人到军中当向导。
经过近两个多月的行军，六月初三，三十万陆军，十万海军合围盛京，秦琼在盛京的南门架起二百余门九寸火炮，对盛京的南城发动了炮击。猛烈的炮火轰击了一个时辰，把盛京的南城轰得一片狼藉，城墙轰塌了一段长达三百丈长的豁口，盛京城的南门也被炮弹炸成一堆木屑。
赵云、李定国、李来亨、堵胤锡各率一万五千骑兵顺着大炮炸开的缺口冲进盛京城，随后，李国英、卢光祖、金生恒、水鉴等人率领十五万步兵紧随骑兵身后杀进城中。
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